Sejarah awal berdirinya margaria Batik ditandai pada tahun 1960, ketika waktu itu toko Wisma Batik margaria beralamat di Jalan Ahmad Yani 69, yakni di kawasan bisnis Malioboro Yogyakarta. Sejak awal berdiri, margaria bergerak di bidang retail busana batik, yang kemudian berkembang hingga mempunyai beberapa gerai usaha sejenis, yaitu Butik Batik margaria, margaria Galeria Batik, Rotowijayan Batik dan Nandia Batik.